פרשיית דור מיכה ועומר אצילי, מעבר לאירוע עצמו והשלכותיו על המעורבים והמעורבות, היא ללא ספק כאב ראש רציני למיץ' גולדהאר. הבעלים נאלץ להתמודד עם אירוע שחרג מגבולות המגרש ולמרות שהצהובים זכו באליפות השנייה שלהם ברציפות, הנזק התדמיתי שנעשה הוא גדול. שחרורם של השחקנים גרם לנו לחזור למספר פרשיות שהטילו צל על היכולת של מכבי תל אביב על הדשא והעלה את המועדון לכותרות מסיבות שעיקרן לא כדורגל.
הפרידה מדרור קשטן:
למרות שקשטן בעיקר מזוהה עם הפועל תל אביב, בשנות ה-90 המאמן עמד על הקווים של הצד הצהוב של העיר והיה חתום על חזרתה של האימפריה. השיא הגיע כאשר קשטן הצעיד את הצהובים לדאבל גדול בעונת 95-96. למרות החגיגות הגדולות, בהנהלת מכבי תל אביב (דיויד פדרמן אז היה הבעלים) החליטו שהם מעוניינים להיפרד ממנו, ללא סיבה ברורה ולמנות במקומו את אברם גרנט. ההחלטה הזו גררה שאלות רבות שאינן פתורות עד היום, והובילה את הצהובים לשנים רעות מאוד. מה עלה בגורלו של קשטן? הוא המשיך לבית''ר ירושלים ולקח עימה אליפות ולאחר מכן להפועל ת''א וההמשך ידוע.
פרשיית שלמה שרף - אבי נמני:
מי שהיה המאמן הלאומי שהוביל את נבחרת ישראל בתקופתה הנהדרת של אייל ברקוביץ' וחיים רביבו, הגיע בקיץ של שנת 2000 לקריית שלום. לאחר שני משחקים בלבד, המאמן פוטר לאחר סכסוך מתוקשר עם כוכב הקבוצה אבי נמני. הקפטן האגדי של הצהובים הוביל מעין מרד של השחקנים, שכלל התבטאות של נמני חזרה בתקשורת, כשאמר ששרף "מתבטא כמו בשוק". הפרשייה הסתכמה באימון בוקר אליו שרף לא הגיע והשחקנים לא היו מוכנים לעלות על הדשא להתאמן. לבסוף פוטר המאמן מבלי שחזר לקריית שלום שוב.
עזיבתו של אבי נמני לבית''ר ירושלים:
הכח של נמני כשחקן מכבי תל אביב הוכח פעם נוספת בצורה משמעותית הרבה יותר מספר שנים לאחר מכן. ניר קלינגר, בזמנו מאמן הצהובים, החליט לשחרר את מלך השערים של הקבוצה בכל הזמנים ועימו גם את טל בנין. המעבר של החלוץ לבית''ר ירושלים גרמה לתנועת מחאה גדולה בקרב אוהדי מכבי ת"א, כולל הגעה למשחקי הקבוצה עם חולצות שחורות, כאשר בסופו של דבר הצליחו לשכנע את ראשי המועדון להשיב את נמני הביתה.
פרשת האפדרין
בסיום עונת 98-99 כפיר אדרי, אז שחקן מכבי תל אביב, הגיע לבדיקת סמים בסיום משחק ההפסד לאלופה הפועל חיפה. בבדיקה התגלה סם האפדרין בדמו של אדרי. זו הייתה הפעם הראשונה שהתגלה בגופו של כדורגלן בישראל חומר האסור לפי התקנון.
בית הדין של ההתאחדות קבע כי החומרים הממריצים חולקו לשחקנים בחדר ההלבשה לפני תחילת המשחקים בגלוי ואף לעיני המאמן דאז, אברם גרנט. בעקבות המקרה, אדרי הורחק משישה משחקים ומאמן הכושר, גיא עזורי, הורחק לשנתיים מכל פעילות. למכבי תל אביב הופחתו 4 נקודות בעונה שלאחר ונוסף לקנס בסך 100 אלף ש"ח.
הפרידה מנמני כמנג'ר:
הפרשייה האחרונה שכללה את השחקן והקבוצה היה כמאמן. נמני היה המאמן הראשון בתקופתו של מיץ' גולדהאר. אחרי יכולת רעה מאוד וניצחון אחד בודד במשחקי הדרבי (בגביע הטוטו), הבעלים הקנדי בחר להיפרד מהסמל הכי גדול של הקבוצה בשיחת טלפון והפעם זה היה לתמיד. נראה שגולדהאר מעולם לא חשש לקחת החלטות הרות גורל עבוד המועדון התל אביבי.
מהראן ראדי:
פרשייה נוספת שחרגה מגבולות המגרשים הגיע מזווית אחרת, מפוקפקת הרבה יותר. מהראן ראדי היה אחד השחקנים הבולטים בשלוש האליפויות הרצופות של הצהובים בתחילת העשור הקודם. הקשר סבל מגזענות מצד קיצוניים ביציעי מכבי תל אביב, אשר כללה איומים וקריאות גזעניות. המצב יצר אי שקט גדול סביב המועדון וגם בתוך חדר ההלבשה. לבסוף האירועים הללו גרמו לעזיבתו להפועל באר שבע ומאז לא דרך שחקן ממוצא ערבי במועדון.