אחרי שהצליחה לשרוד בליגה הלאומית במשחקי המבחן, בהנהלת הפועל עכו החליטו שהם רוצים לבצע שינוי על הקווים לקראת העונה הבאה והחליטו על מינוי אלי כהן מונה שיסגור מעגל לאחר שעזב את הקבוצה לפני שבע שנים.
ב-2010 מונה כהן למאמן הפועל עכו ואימן אותה בליגת העל במשך שנתיים. לאחר מכן נדד להפועל רמת גן, בית"ר ירושלים, בני סכנין, הפועל חיפה והפועל כפר סבא. את העונה החל בתור מנג'ר הפועל רמת השרון, אבל ירד לקווים ופוטר בהמשך.
כהן בן ה-58 הגיע לסיכום עם יו"ר הפועל עכו, קרן בן נשר, וחתם באופן רשמי. עדיין לא ברור איזו קבוצה תעמיד עכו לעונה הקרובה, כאשר לא מעט תלוי במכירתו של בן אז'ובל. במקביל, במועדון יעשו מאמץ להשאיר את ינון אליהו, גל קולני, רועי שוקרני ואליאור סיידר.
להנהלת עכו הייתה התלבטות קשה האם להשאיר את חיים לוי שרשם הצלחה יחסית, אבל בסופו של דבר החליטו לבצע שינוי. "הוא מאמן מצוין שהוכיח שהוא ראוי לאמן בליגה הלאומית", החמיאו בעכו לכהן. "מאחלים לו הצלחה".