לצד הדרמות, משחקי שלב שמינית גמר גביע המדינה סיפקו גם רגעי מחלוקת, ובמוקד היה השיפוט בקריית שמונה, עשר בין היתר אושר שער נגד מכבי תל אביב על אף שהכדור לא עבר את הקו במלוא היקפו. באולפן הלילה של ערוץ הספורט, אייל ברקוביץ' מתח ביקורת חריפה: "לא יכול להיות שבשלב הזה אין את עין הנץ. מה ההבדל בין רבע גמר לשמינית או לחצי גמר?".
ברקוביץ' הוסיף: "גם לדעתי לא היה גול. ביום שבת ראינו שחקן ליגת על יורד מהמגרש עם עגלת סופר, אחרי זה ראינו את אוהדי חיפה קונים לחמניות עם עובש, שרושמים כרטיסים ביד והיום לא היה את עין הנץ. אי אפשר לנהל ככה כדורגל. או שעושים כדורגל רציני עד הסוף, או שזאת שכונה ואז בואו נסגור את הבאסטה".
"אני מאשים את המנהלת וההתאחדות", המשיך הקוסם. "אם אתם רואים לחמניות באצטדיון עם עובש, תענישו. כמו שחקן שמקבל אדום או שופט. אי אפשר להמשיך ככה, יש אוהדים קונים כרטיסים רוצים יחס טוב".
ולצד הביקורת לגופים המארגנים, לשחקנים לעומת זאת, לברקוביץ' היו מחמאות: "גם בגביע וגם בליגה, השערים שמובקעים הם מהיפים בעולם. אתמול הגול של לבאן קוטאליה, מה זה הדבר הזה? היום אבי ריקן ובשבת גם, יש פה שערים מדהימים לא יודע אם השחקנים גדולים או השוערים חלשים".
אירוע מעורר מחלוקת נוסף היה באצטדיון גרין, שם המשטרה לא אישרה שבדו קרב הפנדלים, הפועל חיפה והפועל אום אל פאחם יבעטו לשער שמאחוריו ישבו אוהדי הקבוצה מהמגזר: "החלטה נהדרת של השופט ואסביר למה: במשחקים האלה, האוהדים של אום אל פאחם אוהדים חמים מאוד, ויכול להיות שהם גם ייכנסו למגרש בפנדל כזה או אחר שלא יילך. אפשר להבין את ההחלטה גם של השוטרים וגם של השופט. אם בגלל זה הם החמיצו? אני חושב שזו החלטה נכונה והכל בסדר".